位於大三巴牌坊後右側，創建於1888年，改建於1901年，廟內供奉哪吒。哪吒廟與周圍建築相比，像一個建築小品，它不和舊城牆及大三巴牌坊競爭墩厚和雄偉，而是通過簡單裝飾材料以不同的虛實對比手法，體現其輕巧別緻的形象。