หากประวัติศาสตร์มาเก๊าเชื่อมโยงกับทะเลจริงๆ แล้วล่ะก็คงจะไม่มีที่ใดที่เหมาะที่จะเป็นพิพิธภัณฑ์ทางทะเลไปมากกว่าจัตุรัสเจดีย์บาร์ราอีกแล้วซึ่งเป็นสถานที่อุทิศให้กับเทพธิดา “อาม่า” ของลัทธิเต๋า ผู้ที่คอยคุ้มครองชาวประมงอีกทั้งยังเป็นสถานที่ที่เชื่อกันว่าชาวโปรตุเกสขึ้นบกเป็นครั้งแรก จุดนี้เองที่เป็นสถานที่ตั้งของพิพิธภัณฑ์ทางทะเล รูปร่างของอาคารเหมือนกับเรือใบที่ทอดสมออยู่ในท่าเรือชั้นใน

ที่ชั้นล่างผู้มาเยี่ยมชมสามารถชมวิถีชีวิตของชาวประมงในมาเก๊าและทะเลจีนใต้ มีการจัดแสดงเรือหลายประเภท อุปกรณ์และวิธีการประมง ปลาและหอยชนิดต่างๆ ที่อยู่ในทะเลในแถบนี้ อีกทั้งยังมีแบบจำลองบ้านชาวประมงที่ทุกคนในครอบครัวมีหน้าที่ทั้งก่อนและหลังกิจกรรมการประมง

ผู้เข้าชมควรเข้าชม “โรงละครอาม่าเล็ก” ที่บอกเล่าตำนานของเทพธิดาอาม่าในภาษาจีนกวางตุ้ง จีนกลาง โปรตุเกส และอังกฤษ

ชั้นแรกเป็นชั้นของการค้นพบที่ยิ่งใหญ่โดยเฉพาะที่เน้นประวัติศาสตร์ทางทะเลของจีนและโปรตุเกสเนื่องจากทะเลเป็นสิ่งที่พาอารยธรรมทั้งสองนี้มาอยู่ร่วมกัน มีการจัดแสดงการเดินทางของนายพลเช็งโฮ ในยุคของราชวงศ์หมิง (ศตวรรษที่ 15) นายพลเช็งโฮทำแผนที่ประเทศอินเดียและอาหรับจากทะเลและเดินทางไปถึงชายฝั่งตะวันออกของแอฟริกา และยังมีการแสดงเส้นทางการค้นพบของชาวโปรตุเกสในศตวรรษที่ 15 และ 16 อีกด้วยพร้อมทั้งตัวอย่างผลิตภัณฑ์ที่มีการค้าขายกันในยุคนั้น เช่น ชา เครื่องเทศ เครื่องถ้วยชาม...

ชั้นที่สองเป็นชั้นสำหรับเทคโนโลยีและการขนส่งทางทะเล และมีการแสดงวิธีที่มาเก๊าเชื่อมต่อกับประเทศอื่นๆ ทางทะเล มีการจัดแสดงเครื่องมือแบบดั้งเดิมหลายอย่างควบคู่ไปกับเรือรุ่นใหม่ล่าสุด เช่น เรือเจ็ตฟอยล์ที่ใช้เชื่อมต่อระหว่างมาเก๊ากับฮ่องกงในทุกวันนี้ ผู้เข้าชมควรดูที่จอภาพที่แสดงสภาพอากาศของมาเก๊า โดยเฉพาะในฤดูไต้ฝุ่นที่ผู้เข้าชมสามารถดูและติดตามการก่อตัวของพายุโซนร้อนเหล่านี้ได้ และเพิ่มเติมสำหรับผู้ชม สามารถชมวิวท้องฟ้าของซีกโลกเหนือ ซึ่งแสดงให้เห็นถึงความสำคัญของดาราศาสตร์ในการใช้นำทาง โดยที่ผู้ชมสามารถเลือกชมวิดิทัศน์ในปีนักษัตรตัวเองได้

ใกล้ๆ ทางออกผู้เข้าชมจะเห็นตู้ปลาต่างๆ ก้นแม่น้ำ น้ำในท่าเรือ แนวปะการัง และสุดท้ายพื้นใต้ทะเลที่มีซากเรือโบราณ ด้านนอกพิพิธภัณฑ์ผู้เข้าชมจะเห็นของที่นำมาจัดแสดงขนาดจริง เช่น เรือมังกรที่คล้ายกับเรือที่ใช้แข่งในเทศกาลเรือมังกร